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La ACMI fue fundada en 1958 por un pequeño grupo de eminentes internistas de Bogotá por iniciativa de los doctores Rafael Carrizosa Argáez y Roberto De Zubiría Consuegra, quienes fueron elegidos como su primer Presidente y Secretario respectivamente. Fue definida entonces estatutariamente como “una entidad de carácter científico y gremial, cuya función debe ser la agrupación de los médicos que ejercen la Medicina Interna” en Colombia. La fundación de la Sociedad Colombiana de Medicina Interna, con objetivos predominantemente gremiales, y para hacer frente al impacto del Instituto de Seguros Sociales en el ejercicio de la profesión, pero que tuvo una breve vida y dio lugar a la aparición de la ACMI que, por no haber desaparecido jurídicamente el nombre de la Sociedad, tuvo que adoptar el nombre de Asociación. El Dr. José María Lombana Barreneche (1854-1928), egresado de la Universidad Nacional, es considerado como el pionero en Colombia de la medicina “clínica”, precursora de la medicina interna como especialidad académicamente definida, y por esta razón la ACMI honra su memoria dando su nombre a la Conferencia Magistral de mayor importancia en el Congreso Colombiano de Medicina Interna. La ACMI cuenta con XXX miembros distribuidos en 12 capítulos, los que comprenden Distrito Capital y 22 departamentos, y es hoy una de las más grandes y más prestigiosas organizaciones médicas de Colombia.
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